1. Undersøkelse av fordøyelsessystemet: Gastroskopi gjør det mulig å observere slimhinnen i spiserøret, magen og tolvfingertarmen, og avsløre lesjoner som gastritt og magesår.
Koloskopi undersøker tykktarmen og endetarmen, og hjelper til med diagnosen kolitt, tykktarmspolypper og tykktarmskreft. Vevsprøver kan også fås gjennom biopsitang for patologisk analyse.
2. Undersøkelse av luftveiene: Bronkoskopi brukes til å undersøke luftrøret og bronkiene, og avsløre lesjoner som lungeinfeksjoner, bronkiale fremmedlegemer og lungekreft. Det tillater også prosedyrer som bronkoalveolær skylling for å hjelpe til med diagnose.
3. Undersøkelse av urinsystemet: Ureteroskopi og cystoskopi gir tilgang til urinlederen og blæren, observerer urinrøret og blæreslimhinnen og urinrørsåpningene, og hjelper til med diagnostisering av nyrestein, blæresvulster og urinrørsforsnevninger.
4. Gynekologisk og obstetrisk undersøkelse: Hysteroskopi tillater direkte observasjon av livmorhulen, diagnostisering av gynekologiske sykdommer som endometriepolypper, submukosale fibroider og intrauterine adhesjoner.
